System pendidikan yang diterapkan di pondok pesantren Darussalam adalah mengkonsentrasikan kegiatan belajar mengajar selama 24 jam bersistem asrama (Boarding School):
Adapun kegiatan belajar mengajar di kelas di Pondok Pesantren Darussalam dimulai pada jam 07.00 s/d 14.50. Adapun untuk kegiatan dan pelajaran olahraga dilaksanakan setelah Shalat Ashar dengan rincian kegiatan sebagai berikut:
A. Agenda Kegiatan Harian Hari Sabtu - Rabu
| No | Waktu | Nama Kegiatan |
Keterangan |
| 1. | 07.00 - 07.15 | Persiapan/ Shalat Dhuha | |
| 2. | 07.15 - 07.55 | Jam Pelajaran Ke-1 | |
| 3. | 07.55 - 08.35 | Jam Pelajaran Ke-2 | |
| 4. | 08.35 - 09.05 | Istirahat | |
| 5. | 09.05 - 09.45 | Jam Pelajaran Ke-3 | |
| 6. | 09.45 - 10.25 | Jam Pelajaran Ke-4 | |
| 7. | 10.25 - 11.05 | Jam Pelajaran Ke-5 | |
| 8. | 11.05 - 11.45 | Jam Pelajaran Ke-6 | |
| 9. | 11.45 - 13.30 | Shalat Dzuhur dan Makan Siang | |
| 10. | 13.30 - 14.10 | Jam Pelajaran Ke-7 | |
| 11. | 14.10 - 14.50 | Jam Pelajaran Ke-8 | |
| 12. | 14.50 - 15.45 | Shalat Ashar dan Tadarus | |
| 13. | 15.45 - 17.00 | Olah Raga | |
| 14. | 17.00 - 18.30 | Shalat Maghrib dan Tadarus | |
| 15. | 18.30 - 19.15 | Makan Malam | |
| 16. | 19.15 - 19.45 | Shalat Isya | |
| 17. | 19.45 - 21.00 | Muwajjah (Belajar Terbimbing) |
B. Agenda Kegiatan Harian Hari Kamis
| No | Waktu | Nama Kegiatan |
Keterangan |
| 1. | 07.00 - 07.15 | Persiapan/ Shalat Dhuha | |
| 2. | 07.15 - 07.55 | Jam Pelajaran Ke-1 | |
| 3. | 07.55 - 08.35 | Jam Pelajaran Ke-2 | |
| 4. | 08.35 - 09.15 | Jam Pelajaran Ke-3 |
|
| 5. | 09.15 - 09.55 | Jam Pelajaran Ke-4 | |
| 6. | 09.55 - 10.25 | Istirahat | |
| 7. | 10.25 - 11.05 | Pramuka | |
| 8. | 11.05 - 11.45 | Pramuka | |
| 9. | 11.45 - 13.30 | Shalat Dzuhur dan Makan Siang | |
| 10. | 13.30 - 14.10 | Kegiatan Ekstrakurikuler | |
| 11. | 14.10 - 14.50 | Kegiatan Ekstrakurikuler |
|
| 12. | 14.50 - 15.45 | Shalat Ashar dan Tadarus | |
| 13. | 15.45 - 17.00 | Olah Raga | |
| 14. | 17.00 - 18.30 | Shalat Maghrib dan Shalat Tasbih | |
| 15. | 18.30 - 19.15 | Makan Malam | |
| 16. | 19.15 - 19.45 | Shalat Isya | |
| 17. | 19.45 - 21.00 | Muhadloroh (Latihan Pidato) |
